哈尔滨工程大学船舶工程学院前身系1953年创立的哈尔滨军事工程学院（哈军工）海军工程系造船科。目前已经成为我国船舶工业、海军装备和海洋开发领域科学研究与人才培养的重要基地。学院设有“船舶与海洋工程”、“港口航道与海岸工程”2个本科专业，具有 “船舶与海洋结构物设计制造”、“流体力学”、“港口、海岸及近海工程”、“工程力学”、“一般力学与力学基础”、 “水力学及河流动力学”6个硕士学位授予权，具有“船舶与海洋工程”和“力学”2个一级学科博士学位授予权，具有“船舶与海洋结构物设计制造”、“流体力学”、 “工程力学”、“一般力学与力学基础” 4个二级学科博士学位授予权，设有“船舶与海洋工程”、“力学”2个博士后科研流动站，拥有国家级重点学科1个，国防重点学科1个，省部级重点学科1个。此外“船舶与海洋工程”专业为黑龙江省重点专业和国家特色专业。

学院下设船舶设计与制造技术研究所、船舶与海洋工程力学研究所、深海工程技术研究中心、舰船总体与系统工程研究所、港口航道与近海工程研究所、海洋可再生能源研究所、水运规划设计院等 7个研究所，拥有军用水下xx重点实验室、船舶与海洋工程国家级实验教学示范中心、多体船技术国防重点学科实验室、国家“111”创新引智基地——深海工程技术研究中心和船舶科学与技术黑龙江省重点实验室等。

学院现有教师151人，其中中国工程院院士1人，正高级职称43人,副高级职称45人,中级职称64人。共有博士导师34人，硕士生导师77人。